โปรตีนหนามของไวรัสโควิดสายพันธุ์ B.1.617

โปรตีนหนาม (Spike protein) เป็นโปรตีนที่ทำหน้าที่ในการจับกับโปรตีนของมนุษย์เพื่อเริ่มการติดเชื้อ และเป็นโปรตีนที่โดดเด่นที่สุดที่อยู่บนผิวนอกของไวรัส สายพันธุ์กลาย B.1.617 จากแดนภารตะนี้ ที่จริงมีการกลายพันธุ์บนโปรตีนหนามมากถึง 13 ตำแหน่ง แต่มีที่สำคัญและเป็นที่จับตามองจริงๆ ของผู้เชี่ยวชาญอยู่สองตำแหน่ง ตำแหน่ง 452 คือการกลายพันธุ์ที่พบเช่นกันในไวรัสสายพันธุ์แคลิฟอร์เนีย เชื่อกันว่าจะทำให้ไวรัสกระจายได้เร็วขึ้น ตำแหน่งนี้เปลี่ยนจากกรดอะมิโนลิวซีน (L) ไปเป็นอาร์จินีน (R) จึงเรียกว่า L452R ตำแหน่ง 484 คือการกลายพันธุ์ที่เปลี่ยนกรดอะมิโนเดิมที่เป็น กรดกลูตามิก (E) ไปเป็นกลูตามีน (Q) จึงเรียกว่า E484Q การกลายพันธุ์แบบนี้พบได้เช่นกันในไวรัสสายพันธุ์กลายบราซิล และแอฟริกาใต้ แต่ในอีกสองสายพันธุ์ ตำเเหน่งนี้จะเปลี่ยนไปเป็นไลซีน (K) แทนที่จะเป็นกลูตามีน ในอีกสองสายพันธุ์กลายจึงเรียกการกลายพันธุ์ตำแหน่งนี้ว่า E484K